Похоронен в Екатеринбурге на Широкореченском кладбище. Фото Владимира Рогова 09.05.2009 года.

Мемориальная доска Герою Российской Федерации С.А. Багаеву. Установлена на здании Военно-исторического музея Военно-морского флота в Екатеринбурге в 2013 году.

Уголок Памяти Героя Российской Федерации С.А. Багаева в расположении отдела специального назначения (базового) ГУФСИН России по Свердловской области (Екатеринбург). Фотография предоставлена сотрудниками ГУФСИН России по Свердовской области.

Мемориальная доска установлена на доме, где жил БАГАЕВ СА в городе ЕКАТЕРИНБУРГ. Фото Александра Захарова. Фото 08.07.2017.